第一步：水中有机垃圾被净水细菌分解将会转变为氨，氨在水中转化为铵。

　　第二步：生存于水中的硝化细菌（亚硝酸菌属细菌）能通过氧把铵会转变为亚硝酸盐；硝酸盐虽然毒性教低，但高浓度的话有致命的毒害。

　　第三步：亚硝酸盐之后又被第二种硝化细菌（硝酸菌属细菌）转变为硝酸盐；而硝酸盐几乎是无毒的，但突然或长期暴露在高浓度的硝酸盐里是有害的。

　　第四步：硝酸盐会被厌氧性细菌（反硝化细菌）变为氮气而升华。硝酸盐又是藻类等植物的最佳氮肥，能被植物所吸收及同化。